Разница может быть лишь в том случае, если сайт в разные поисковые системы добавлялся в разное время, в одну поисковую систему раньше, в другую позже, через неделю, две или месяц. И также стоит учитывать то, что каждая поисковая система по своему индексирует, в каждой свои алгоритмы и свои правила учета страниц при индексации, не стоит ожидать тех же цифр в выдаче гугла, что и в яндексе, так как данные всегда будут разниться. Проверьте гугл вебмастер, добавили вы там карту сайта, если добавили и в гугле и в яндексе, в таком случае лишь ждать индексацию так как ее не ускорить.