Это не баг, так системно заложено. Системно так задумано из-за того, что удаляя страницы в редакторе страниц, в меню некоторые из них могут быть вложенными и с данными страницами может удалиться целая пачка(вложения) подстраниц.
Представьте, имеете вы в меню страницу с десятком вложенных подстраниц(подпунктов), если как вы выражаетесь данный баг был выполнен так как вы хотите, удалив одну страницу которая является главной в меню и содержит вложенные подпункты, вы удалили бы много пунктов в меню, а после бы спрашивали, что случилось, у меня меню само очистилось.
Вот из-за этого пока не реализуется связь редактор страниц с меню сайта при удалении страниц с модуля Редактор страниц, так как кроме вас имеются 10-ки тыс пользователей и будет очень много жалоб если реализовать как вы хотите.