Реально, в данном случае код:
<?if($AUTHOR_PHONE$)?><span class="ed-sep"> | </span><span class="e-author-phone"><span class="ed-title"><!--<s5193>-->Телефон<!--</s>-->:</span> <span class="ed-value"><u>$AUTHOR_PHONE$</u></span></span><?endif?>
придется заменить на следующий:
<?if($AUTHOR_PHONE$)?><span class="ed-sep"> | </span><span class="e-author-phone"><span class="ed-title"><!--<s5193>-->Телефон<!--</s>-->:</span> <span class="ed-value"><u><a href="tel:$AUTHOR_PHONE$">$AUTHOR_PHONE$</a></u></span></span><?endif?>
выделенное красным поможет в реализации задуманного. После если в объявлении прописан номер телефона, при нажатии на него будет предложено запустить приложение поддерживающее звонки, если установлен скайп, запустит его или же вайбер.