Все правильно вам ответили, на странице категории установите условие:
<?if($CAT_URL$)?><link rel="canonical" href="$CAT_URL$" /><?endif?>
в блоке <head>здесь</head>
Если оплатить пакет оптимальный и подключить модуль сео, то можно установить условие:
<?if($SEO_CANONICAL$)?>$SEO_CANONICAL$<?endif?>
в данном случае все правильно работает, переходя на страницу например 2-1 то есть первая страница категории, мы имеем урл 2 то есть прямая ссылка на категорию, каноникал не даст сделать дубль и здесь верно работает, первая страница это и есть прямая ссылка на категорию, а 2-1 это дубль который вы видите лишь при возврате, но если смотреть каноникал, то там все верно срабатывает.
Контент-модули
Продвижение сайта
Управление сайтом