Не нужно. Робот сам увидит изменения и выдаст в вебмастере много ошибок 404. Переобход делать не нужно так как переиндексировать нечего материалов же нет и соответственно робот не сможет увидеть материалы. Просто ждите переиндексацию модуля новости и очистку выдачи в поисковиках Если материалов было много удалено, может потребоваться 3 и более месяца.