Если вы об системной индексации то есть внутри сайта, а не поисковиками, то перейдите в настройки модуля поиск http://ваш-сайт.ру/panel/?a=search;l=setup увидите список модулей и уберите отметку с необходимого. Если же нужно отключить индексацию в поисковиках, в данном случае нужна конкретная ссылка на ваш сайт и о каком модуле речь.